Nature:全新致癌机制,相分离涡轮异常染色质成环,促进癌症发展

2022-01-17 12:16 来源:安康妇科医院

乳癌的蓬勃发展与特异功能性酵素内在无序区可定义(IDR)的基因氨基酸精神状态密切系统功能性。各种酵素(最主要特异功能性系数、染色质调节剂和RNA相结合蛋白)之前的IDR通过液-液比方说(LLPS)转变成凝聚器皿,阻碍从线粒体器转变成和其会耐受到基因氨基酸特异功能性的无数生器皿体流程。

是非的液-液比方说(LLPS)是特指融合两个不系统功能性基因氨基酸突变的流程。该流程时有发生在线粒体核内,并能够转变成具各种器皿理特功能性的可定义,这些可定义可以增进乳癌,例如急功能性肺炎的时有发生蓬勃发展。在急功能性肺炎之前,大分子蛋白(NUP98或NUP214)的反复线粒体反之亦然产生了一种精神状态融合体,它好像延续大分子蛋白 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸残基(FG)的串联分散多次重复氨基酸。然而,IDR如何导致基因氨基酸正确调控和时有发生唯不明了。

2021年6月23日,以东卡罗莱纳大学教堂山分校 Gang Greg Wang 设计团队等 Nature 刊出了月出版:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的学术研究博士论文。

该学术研究证明了比方说是乳癌转变成的特别设计因素所,乳癌通过比方说获得突变以创建致癌功能性特异功能性系数凝聚器皿,这同时强化了它们的基因氨基酸组特异功能性功能性并在裂解流程之前其会精神状态图像染色质结构的转变成。该学术研究是最早将比方说与乳癌转变成直接联系起来的学术研究之一。因为在其他恶功能性之前辨别到了相近的基因氨基酸融合,社论之前概述的选择性也可以解释其他类型的乳癌。

NUP98–HOXA9包含两个酵素基序和一个相结合氨基酸。为了学术研究NUP98-IDR在肺炎时有发生之前的功用,学术研究设计团队主要使用敲击除了相结合氨基酸的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们注意到,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏相-比方说凝聚体的化学器皿质)处理脆弱。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)蛋白在胃转变成液体凝聚器皿。

为了必要功能性分析FG多次重复氨基酸对凝聚器皿转变成的酸度发挥功用和多价功能性的重要功能性,学术研究设计团队制备了带有不同为数FG多次重复氨基酸的整合N-IDR酵素。他们注意到N-IDR包含38个或36个FG以酸度发挥功用的方式多次重复转变成的冷凝,那些包含27个或11个FG的却不能完成比方说。暗示NUP98–HOXA9之前的IDR以价依赖和酸度依赖的方式创建LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源结构可定义与DNA相结合,导致肺炎时有发生流程之前的基因氨基酸失调。接下来,学术研究设计团队通过染色质免疫沉淀和生物信息学测序来分析IDR介导的比方说对NUP98–HOXA9染色质特异功能性功能性的阻碍。

结果显示, N-IDRWT/A9具显着强化的基因氨基酸组占有率,而与无指导聚类定义的岩值亚类无关。此外,宽而密集的超强强化子样岩是N-IDRWT/A9所都有的,并且在发育期和肺炎系统功能性基因氨基酸富集。

为了必要功能性分析IDR其会的LLPS在斯氏染色质特异功能性之前的功用,他们透过了遗传学和药理学的方法,证明了IDR介导的LLPS在强化嵌合特异功能性系数特异功能性功能性方面的因果功用,密切系统功能性超强强化子样岩处看到的那些。暗示IDR强化融合体的基因氨基酸组相结合并且强化靶基因氨基酸启动时。

为了测试NUP98–HOXA9通过LLPS转变成染色质循环系统的能够,学术研究设计团队生成了表达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9线粒体的Hi-C图谱,揭示了DNA循环系统和复制间的离地系统功能性功能性。

为了具体N-IDRWT/A9对Hi-C交谈kHz的阻碍,他们群聚了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表达线粒体之前500个最极端的N-IDRWT/A9守住位点间的相互功用除此以外。结果显示,N-IDRWT/A9循环系统以基本上与CTCF无关的方式转变成,与比方说特别设计选择性明确。另外,N-IDRWT/A9特异功能性循环系统再度连结强化子和靶基因氨基酸间的连结,支持了融合特异功能性系数的IDR通过比方说在超强强化子样靶点和癌基因氨基酸间其会DNA循环系统的观点。

综上所述,该学术研究注意到NUP98–HOXA9之前带有的LLPS活功能性IDR对肺炎的时有发生和致癌功能性基因氨基酸表达程序的启动时至关重要。这些不稳定性由IDR的能够介导:1)强化特异功能性系数与基因氨基酸组靶点的相结合;2)增进强化子和癌基因氨基酸启动子间的长距离循环系统。

该学术研究提供了一个致癌功能性突变的基本原理功能性证据,该突变在裂解流程之前增进LLPS特别设计的特异功能性系数相结合和3D染色质整合。由于含IDR的LLPS活功能性分子与广泛的乳癌有关,该学术研究概述的选择性也可以解释其他类型的乳癌。

原始说是:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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